1. Instituce státní správy politické, finanční, justiční
Politická správa
Okresní úřad Strakonice I (1817) 1850–2003; Okresní úřad Vodňany 1850–1942; Okresní úřad Blatná 1855–1945 (1956); Okresní úřad Volyně 1855–1868; Okresní úřad Strakonice II (1960) 1981–2004.
Městský úřad Strakonice 1990–2007.
Internační středisko pro německé uprchlíky Strakonice 1945–1946.
Národní výbory
Okresní národní výbor Strakonice (1886) 1944–1990; Okresní národní výbor Blatná 1945–1960; Okresní národní výbor Vodňany 1940–1960 (1964).
Justiční správa
Okresní soudy
Okresní soud Strakonice 1850–1997; Okresní soud Blatná (1841) 1850–1960; Okresní soud Vodňany 1850–1960; Okresní soud Volyně 1850–1953.
Policejní fondy
3 fondy okresních četnických velitelství 24 četnických stanic.
Okresní prokuratury
Okresní prokuratura Blatná 1949–1960; Okresní prokuratura Vodňany 1949–1960.
2. Instituce samosprávné
Archivy měst
Archiv města Bavorov 1361–1945 (1949); Archiv města Bělčice (1556) 1850–1945; Archiv města Blatná 1489–1945; Archiv města Radomyšl 1483–1945 (1955); Archiv města Sedlice 1539–1945 (1961); Archiv města Nové Strakonice (1772) 1850–1932; Archiv města Strakonice 1367–1945 (1947); Archiv města Volyně 1370–1945 (1952); Archiv města Vodňany 1336–1945 (1948).
Archivy obcí
204 fondů archivů obcí – místní samospráva do roku 1945.
Okresní samospráva
Okresní zastupitelstvo Strakonice 1864–1928 (1932); Okresní zastupitelstvo Blatná 1865–1942; Okresní zastupitelstvo Vodňany (1860) 1864–1927 (1929); Okresní zastupitelstvo Volyně 1866–1927 (1928).
3. Církevní fondy
Kazatelská stanice Československé církve evangelické Nahořany 1925–1951; Bratrstvo svatého růžence Vodňany 1672–1829; Bratrstvo Panny Marie Vítězné Strakonice 1657–1858.
Vikariátní úřad Blatná [1786]–1938; Vikariátní úřad Vodňany 1743–1958; Vikariátní úřad Volyně 1694–1948; Děkanský úřad Bavorov 1359–1954; Děkanský úřad Bělčice 1604–1996; Děkanský úřad Vodňany (1404) 1657–1951; Děkanský úřad Volenice 1510–1987; Děkanský úřad Volyně 1590–1949.
4. Školy
Gymnázium Strakonice 1953–2005; Vyšší odborná škola a Střední průmyslová škola Strakonice 1959–2002; Odborná škola pro ženská povolání Strakonice 1892–1949 (1953); Střední rybářská technická škola Vodňany 1919–1961; Střední průmyslová škola Volyně 1864–2003; Speciální škola pro sluchově postižené Volyně 1962–2001; Zvláštní škola internátní Strakonice-Střela 1945–1995.
5. Hospodářské instituce
Právovárečné měšťanstvo Strakonice 1866–1948; Pošumavské pletárny Vodňany 1950–1969; Pletárny PVV – mode, výrobní družstvo Vodňany 1969–2003; Průmysl kamene Blatná [1966]–[1970]; Federace lokomotivních čet Blatná 1968–1969.
6. Jiné
Spolky
Divadelní spolek Čelakovský Strakonice 1932–1946; Muzejní spolek Strakonice 1891–1952; Spolek pro okrašlování a ochranu domoviny Renner Strakonice 1845–1951; Pěvecký spolek Palla Strakonice 1924–1971; Pěvecko-hudební spolek Zvon Strakonice 1861–1958; Zábavní spolek mládenců Veselost Blatná 1912–1929.
Politické strany
KSČ – okresní výbor Strakonice 1945–1989; KSČ – okresní výbor Blatná 1946–1960; KSČ – místní organizace Vodňany 1945–1960; KSČ – celozávodní výbor České závody motocyklové Strakonice 1974–1986.
Cechy
Cech koželuhů Strakonice 1580–1892; Cech krejčích Strakonice 1574–1863; Cech punčochářů Bavorov 1661–1860 (1861); Cech hrnčířů Volyně 1488–1588; Cech pekařů, mlynářů a truhlářů Volyně 1490–1860 (1862).
Kulturní instituce
Muzeum středního Pootaví Strakonice 1951–2004; Muzeum Vodňany 1979–1989.
Osobní fondy
Rudolf Beran [1920]–1947; Jan Braun 1926–1959; Jan Dyk 1917–1924; Jan Pavel Hille 1873–1942; Marie Jakší 1900–1965; Václav Kremmer, Dr. 1930–1980; Jan Olejník [1990]–2009; Ladislav Rom (1899) 1925–2004; František Spilka [1900]–2010; Josef Šmidinger 1837–1962 (1934); Marie Votýpková 1928–1946; Vítězslav Zenkl 1895–1966 [1970].